Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE3AQ05086 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE3AQ05086 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms