Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms