Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms