Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms