Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN8P56748 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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