Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CLDN15P56746 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CLDN15P56746 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CLDN15P56746 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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CLDN15P56746 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CLDN15P56746 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CLDN15P56746 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CLDN15P56746 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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