Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms