Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMSP52788 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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