Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF140P52738 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms