Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms