Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB28P51157 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB28P51157 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB28P51157 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB28P51157 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB28P51157 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB28P51157 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB28P51157 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RAB28P51157 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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RAB28P51157 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RAB28P51157 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RAB28P51157 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB28P51157 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RAB28P51157 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RAB28P51157 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB28P51157 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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