Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBP50607 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBP50607 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBP50607 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms