Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERFP50548 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERFP50548 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERFP50548 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERFP50548 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERFP50548 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERFP50548 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERFP50548 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERFP50548 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERFP50548 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERFP50548 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERFP50548 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ERFP50548 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERFP50548 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERFP50548 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms