Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LTBRP36941 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms