Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms