Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTN2P35609 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms