Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GJA4P35212 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms