Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR5P32302 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms