Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP1P29466 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP1P29466 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP1P29466 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP1P29466 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP1P29466 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms