Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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