Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms