Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD27P26842 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD27P26842 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD27P26842 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms