Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms