Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MMP11P24347 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MMP11P24347 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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MMP11P24347 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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