Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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