Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LIG1P18858 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LIG1P18858 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LIG1P18858 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LIG1P18858 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LIG1P18858 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LIG1P18858 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIG1P18858 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIG1P18858 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms