Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms