Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRAFP15056 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRAFP15056 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRAFP15056 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRAFP15056 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRAFP15056 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRAFP15056 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms