Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC192P0DO97 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms