Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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