Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTSLP07711 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSLP07711 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms