Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms