Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms