Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG7O95352 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG7O95352 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG7O95352 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms