Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIOO75962 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIOO75962 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIOO75962 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIOO75962 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIOO75962 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIOO75962 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIOO75962 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIOO75962 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIOO75962 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIOO75962 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIOO75962 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIOO75962 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIOO75962 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms