Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms