Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PRAMEF10O60809 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PRAMEF10O60809 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PRAMEF10O60809 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PRAMEF10O60809 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PRAMEF10O60809 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF10O60809 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms