Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ACSL4O60488 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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ACSL4O60488 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSL4O60488 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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