Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms