Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GIPC1O14908 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms