Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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USP9YO00507 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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USP9YO00507 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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USP9YO00507 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USP9YO00507 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
USP9YO00507 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
USP9YO00507 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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USP9YO00507 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
USP9YO00507 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
USP9YO00507 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
USP9YO00507 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9YO00507 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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