Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms