Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PIPSLA2A3N6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms