Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TRAF6Q9Y4K3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TRAF6Q9Y4K3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TRAF6Q9Y4K3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TRAF6Q9Y4K3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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