Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GIT1Q9Y2X7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIT1Q9Y2X7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms