Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms