Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms