Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL9

CRCT1, Cysteine-rich C-terminal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCT1Q9UGL9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 AL512288.2-201ENST00000426041 367 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 SRP9-205ENST00000626563 329 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CRCT1Q9UGL9 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms