Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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