Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRIT1Q9P2V4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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